El Fondo Fiduciario del Codex (FFC) se estableció con la denominación «Proyecto y Fondo FAO/OMS para Aumentar la Participación en el Codex» con el objetivo de apoyar a los países en desarrollo y con economías en transición para que participaran más eficazmente en la Comisión del Codex Alimentarius y sus comités conexos. 

El FFC es una alianza en pro del desarrollo que constituye el núcleo mismo del sistema mundial del Codex y se sustenta en el mandato directo de todos los países miembros del Codex, entre los que se incluyen países en desarrollo, países con economías en transición y países desarrollados, así como la FAO y la OMS.

• se centra explícitamente en apoyar una colaboración más eficaz de los países en desarrollo y los países con economías de transición en el sistema del Codex.
• tiene acceso directo a los sistemas nacionales del Codex en los países en desarrollo, sobre todo a través de los puntos de contacto del Codex y las estructuras coordinadoras.
• tiene acceso a la capacidad interna y las redes externas de la Secretaría del Codex y las organizaciones patrocinadoras, es decir, la FAO y la OMS.

En estos momentos el FFC se encuentra en su segunda fase, por lo que con frecuencia se denomina «FFC2».

La estructura de gobernanza del FFC consta de un Comité Directivo asesorado por un Grupo Consultivo. El Comité Directivo está integrado por funcionarios superiores de la FAO, la OMS y la Secretaría del Codex. Suele reunirse una vez al mes para orientar la labor de la Secretaría del FFC.

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