Операционные аспекты ускорения геномного секвенирования как компонента эпиднадзора за SARS-CoV-2 через систему ГСЭГО

Обзор

В настоящем документе лабораториям Глобальной системы по эпиднадзору за гриппом и принятию ответных мер (ГСЭГО) (1) и другим национальным лабораториям соответствующего профиля даются практические рекомендации относительно перехода от выявления вируса к геномному секвенированию материалов, положительных на SARS-CoV-2 по ПЦР и полученных при дозорном эпиднадзоре за гриппоподобными заболеваниями (ГПЗ), острыми респираторными инфекциями (ОРИ) и тяжелыми острыми респираторными инфекциями (ТОРИ). К рассматриваемым операционным аспектам относятся отбор образцов для секвенирования, количество подлежащих секвенированию вирусов, метаданные и сроки опубликования данных генетического секвенирования (ДГС), а также возможности технической поддержки.